Zapraszamy do zapoznania się z niemal 30-minutowymi fragmentami warsztatów z zakresu Bioinformatyki dla biologów: analizy profilu transkryptomicznego uzyskanego metodą wysokoprzepustowego sekwencjonowania (NGS) przy użyciu GALAXY!
Udostępnione materiały koncentrują się na:
- kluczowych etapach workflow analizy RNA-seq,
- ocenie jakości odczytów i interpretacji parametrów Phred Score,
- analizie i interpretacji wybranych aspektów uwzględnionych w raporcie FastQC.
Prowadzący: Dr hab. Łukasz Łaczmański, prof. IITD PAN jest absolwentem biotechnologii na Uniwersytecie Wrocławskim. W 2003 roku obronił doktorat w Zakładzie Biofizyki Instytutu Biochemii i Biologii Molekularnej Uniwersytetu Wrocławskiego. Następnie pracował jako diagnosta laboratoryjny. W latach 2006-2016 zorganizował i prowadził Laboratorium Endokrynologii Molekularnej na Uniwersytecie Medycznym we Wrocławiu. Od 2016 roku jest samodzielnym pracownikiem Instytutu Immunologii i Terapii Doświadczalnej PAN we Wrocławiu, a od 2019 roku kieruje nowo utworzonym Laboratorium Genomiki i Bioinformatyki.