Dlaczego mimo wysokich wskaźników w programach bioinformatycznych, system CRISPR/Cas często wykazuje zerową efektywność w warunkach in vivo? Dr inż. Magdalena Klimek-Chodacka, prof. URK podzieliła się doświadczeniem z zakresu optymalizacji systemów edycji u różnych gatunków roślin. Podczas webinaru przeanalizowane zostały krytyczne punkty workflow, o których rzadko wspominają podręczniki: od problemów z optymalizacją kodonów, przez fizykochemiczne pułapki matrycy DNA (struktury typu 'spinka’), aż po precyzyjne szacowanie wydajności systemów tnących w układach in vitro. Uczestnicy poznali techniczne powody porażek oraz autorskie metody weryfikacji gRNA przed etapem transformacji, które pozwalają zwiększyć szansę na sukces w badaniach własnych.
Prowadząca
dr inż. Magdalena Klimek-Chodacka, prof. URK – profesor Uczelni na Wydziale Biotechnologii i Ogrodnictwa Uniwersytetu Rolniczego w Krakowie specjalizująca się w nowoczesnych metodach inżynierii genetycznej roślin. W swojej pracy badawczej opracowała skuteczne procedury edycji genomu marchwi, co przyczyniło się do rozwoju nowych kierunków w biotechnologii gatunków warzywnych. Skupia się na doskonaleniu technologii CRISPR/Cas, rozwijając zarówno wektorowe, jak i bezwektorowe (DNA-free) metody modyfikacji genomów roślin użytkowych.
Swoje doświadczenie naukowe budowała w czołowych światowych ośrodkach, m.in. na East Carolina University w USA (w zespole prof. Yipinga Qi) oraz w Maladze (2025, w grupie Pablo Manavela). Jest laureatką grantów Narodowego Centrum Nauki, w tym projektu OPUS, oraz programu NAWA. Aktywnie kształtuje debatę naukową jako członkini zespołu edytorskiego czasopisma Scientific Reports oraz recenzentka licznych renomowanych czasopism międzynarodowych. Jej dorobek był nagradzany Nagrodami Rektora UR, a jej prace publikowane są w wiodących czasopismach z listy JCR.